一般，常见的引起口腔溃疡的原因有：
1、病毒感染是病原
最近医学界经过临床及免疫研究，已确定主要的引起口腔溃疡的原因为病毒感染，而导致口腔溃疡的两种病毒分别为人类巨细胞病毒和ER病毒。其中人类巨细胞病毒潜伏在血液中的T淋巴细胞，ER病毒则潜伏在血液中的B淋巴细胞，人们一旦感冒、情绪压力大、身体疲倦或精力不足、免疫力差等，病毒就会发作。
2、精神压力与荷尔蒙
专家认为，现代人生活紧张、精神压力大，口腔溃疡也成为一种因生活形态导致的“文明病”，事实上，根据医生的临床观察，口腔溃疡患者有许多是在过度疲劳后发病的。此外，口腔溃疡的原因也被认为与遗传、荷尔蒙等因素有关，如女性月经前口腔溃疡会有恶化情形，更年期妇女则病例有升高现象，但怀孕期妇女则发病率较低，这些现象都显示溃疡的发生受荷尔蒙变化影响。
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